Bem, não nenhum experte no assunto mas acho que o uso da CPU depende mais dos programas que vc está utilizando do que do ambiente gráfico. Quanto ao problema do barulho do cooler, acredito que isso seja um problema na regulação da rotação dele e não no uso de CPU(ele deve estar com rotação alta mesmo quando a CPU não está sendo muito demandada). Talvez seja problema com um driver não muito bom, talvez dê para regular pela BIOs, não sei. Tem que ver também se é o cooler da CPU msm que está fazendo barulho, porque muitos vezes o cooler que faz barulho é o da placa de vídeo.
De kernel eu não manjo, mas uso o 3.12 ck1bfq
http://forum.manjaro.org/index.html?topic=5842.0